Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptpn11P35235 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptpn11P35235 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms