Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stfa3P35173 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stfa3P35173 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stfa3P35173 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stfa3P35173 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stfa3P35173 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stfa3P35173 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stfa3P35173 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stfa3P35173 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stfa3P35173 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stfa3P35173 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stfa3P35173 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stfa3P35173 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stfa3P35173 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stfa3P35173 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Stfa3P35173 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stfa3P35173 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stfa3P35173 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stfa3P35173 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms