Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifnar1P33896 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ifnar1P33896 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifnar1P33896 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms