Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pola2P33611 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pola2P33611 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pola2P33611 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pola2P33611 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pola2P33611 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pola2P33611 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pola2P33611 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pola2P33611 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pola2P33611 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pola2P33611 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pola2P33611 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola2P33611 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pola2P33611 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pola2P33611 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pola2P33611 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola2P33611 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pola2P33611 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms