Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdh15P33146 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdh15P33146 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdh15P33146 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdh15P33146 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdh15P33146 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh15P33146 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 894.8 ms