Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gsx2P31316 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gsx2P31316 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gsx2P31316 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gsx2P31316 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gsx2P31316 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gsx2P31316 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gsx2P31316 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gsx2P31316 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gsx2P31316 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Gsx2P31316 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gsx2P31316 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms