Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cnga1P29974 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Cnga1P29974 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Cnga1P29974 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cnga1P29974 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cnga1P29974 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cnga1P29974 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cnga1P29974 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cnga1P29974 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cnga1P29974 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cnga1P29974 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cnga1P29974 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cnga1P29974 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cnga1P29974 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cnga1P29974 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cnga1P29974 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cnga1P29974 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cnga1P29974 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cnga1P29974 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cnga1P29974 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cnga1P29974 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cnga1P29974 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cnga1P29974 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cnga1P29974 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cnga1P29974 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cnga1P29974 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cnga1P29974 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cnga1P29974 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms