Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mmp3P28862 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mmp3P28862 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp3P28862 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms