Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxrbP28704 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RxrbP28704 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RxrbP28704 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RxrbP28704 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RxrbP28704 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RxrbP28704 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RxrbP28704 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RxrbP28704 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RxrbP28704 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RxrbP28704 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RxrbP28704 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RxrbP28704 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxrbP28704 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxrbP28704 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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