Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col2a1P28481 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col2a1P28481 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.2 ms