Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LoxP28301 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LoxP28301 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LoxP28301 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LoxP28301 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LoxP28301 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LoxP28301 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LoxP28301 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LoxP28301 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LoxP28301 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LoxP28301 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LoxP28301 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LoxP28301 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LoxP28301 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LoxP28301 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LoxP28301 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LoxP28301 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LoxP28301 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LoxP28301 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LoxP28301 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LoxP28301 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LoxP28301 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LoxP28301 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LoxP28301 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LoxP28301 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LoxP28301 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LoxP28301 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LoxP28301 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LoxP28301 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LoxP28301 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LoxP28301 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LoxP28301 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LoxP28301 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LoxP28301 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LoxP28301 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LoxP28301 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LoxP28301 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LoxP28301 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LoxP28301 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LoxP28301 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LoxP28301 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LoxP28301 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LoxP28301 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LoxP28301 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LoxP28301 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LoxP28301 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LoxP28301 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LoxP28301 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LoxP28301 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LoxP28301 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LoxP28301 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LoxP28301 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LoxP28301 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LoxP28301 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LoxP28301 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LoxP28301 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LoxP28301 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LoxP28301 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LoxP28301 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LoxP28301 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LoxP28301 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LoxP28301 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LoxP28301 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LoxP28301 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LoxP28301 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LoxP28301 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LoxP28301 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LoxP28301 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LoxP28301 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LoxP28301 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LoxP28301 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LoxP28301 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LoxP28301 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LoxP28301 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LoxP28301 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LoxP28301 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LoxP28301 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LoxP28301 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LoxP28301 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LoxP28301 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LoxP28301 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LoxP28301 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LoxP28301 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LoxP28301 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LoxP28301 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LoxP28301 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LoxP28301 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LoxP28301 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LoxP28301 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LoxP28301 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LoxP28301 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LoxP28301 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LoxP28301 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LoxP28301 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LoxP28301 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LoxP28301 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LoxP28301 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LoxP28301 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LoxP28301 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LoxP28301 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms