Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja4P28235 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja4P28235 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja4P28235 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja4P28235 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja4P28235 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja4P28235 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gja4P28235 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja4P28235 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja4P28235 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja4P28235 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja4P28235 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja4P28235 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja4P28235 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Gja4P28235 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja4P28235 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja4P28235 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms