Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb3P28231 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms