Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CenpbP27790 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CenpbP27790 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CenpbP27790 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CenpbP27790 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CenpbP27790 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CenpbP27790 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CenpbP27790 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CenpbP27790 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CenpbP27790 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CenpbP27790 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CenpbP27790 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CenpbP27790 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CenpbP27790 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CenpbP27790 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CenpbP27790 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CenpbP27790 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CenpbP27790 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CenpbP27790 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CenpbP27790 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CenpbP27790 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CenpbP27790 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CenpbP27790 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CenpbP27790 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CenpbP27790 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CenpbP27790 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CenpbP27790 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CenpbP27790 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CenpbP27790 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CenpbP27790 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CenpbP27790 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CenpbP27790 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CenpbP27790 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CenpbP27790 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CenpbP27790 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CenpbP27790 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CenpbP27790 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CenpbP27790 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CenpbP27790 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CenpbP27790 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CenpbP27790 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CenpbP27790 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CenpbP27790 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CenpbP27790 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CenpbP27790 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CenpbP27790 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CenpbP27790 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CenpbP27790 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CenpbP27790 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CenpbP27790 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CenpbP27790 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CenpbP27790 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms