Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tgfb2P27090 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tgfb2P27090 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tgfb2P27090 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Tgfb2P27090 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tgfb2P27090 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tgfb2P27090 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tgfb2P27090 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.9 ms