Protein–RNA interactions for Protein: P26952

Il3ra, Interleukin-3 receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il3raP26952 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Il3raP26952 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Il3raP26952 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Il3raP26952 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il3raP26952 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Il3raP26952 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Il3raP26952 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Il3raP26952 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Il3raP26952 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Il3raP26952 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Il3raP26952 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Il3raP26952 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Il3raP26952 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Il3raP26952 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Il3raP26952 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms