Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nfkb1P25799 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfkb1P25799 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nfkb1P25799 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nfkb1P25799 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfkb1P25799 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfkb1P25799 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms