Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NdnP25233 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NdnP25233 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NdnP25233 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NdnP25233 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NdnP25233 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NdnP25233 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NdnP25233 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NdnP25233 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NdnP25233 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NdnP25233 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NdnP25233 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NdnP25233 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NdnP25233 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NdnP25233 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NdnP25233 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NdnP25233 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NdnP25233 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NdnP25233 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NdnP25233 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NdnP25233 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NdnP25233 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NdnP25233 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NdnP25233 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NdnP25233 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NdnP25233 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NdnP25233 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NdnP25233 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NdnP25233 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NdnP25233 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NdnP25233 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NdnP25233 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NdnP25233 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NdnP25233 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NdnP25233 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NdnP25233 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NdnP25233 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NdnP25233 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NdnP25233 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NdnP25233 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NdnP25233 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NdnP25233 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NdnP25233 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NdnP25233 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NdnP25233 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NdnP25233 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NdnP25233 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NdnP25233 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NdnP25233 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NdnP25233 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NdnP25233 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NdnP25233 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NdnP25233 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NdnP25233 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NdnP25233 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NdnP25233 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NdnP25233 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NdnP25233 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NdnP25233 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NdnP25233 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NdnP25233 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NdnP25233 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NdnP25233 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NdnP25233 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NdnP25233 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NdnP25233 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NdnP25233 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NdnP25233 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NdnP25233 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NdnP25233 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NdnP25233 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NdnP25233 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NdnP25233 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NdnP25233 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NdnP25233 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NdnP25233 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NdnP25233 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NdnP25233 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NdnP25233 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NdnP25233 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NdnP25233 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NdnP25233 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NdnP25233 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NdnP25233 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NdnP25233 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NdnP25233 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NdnP25233 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NdnP25233 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NdnP25233 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NdnP25233 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NdnP25233 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NdnP25233 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NdnP25233 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NdnP25233 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NdnP25233 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NdnP25233 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NdnP25233 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NdnP25233 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NdnP25233 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NdnP25233 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms