Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pax3P24610 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pax3P24610 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pax3P24610 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pax3P24610 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pax3P24610 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pax3P24610 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pax3P24610 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pax3P24610 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pax3P24610 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pax3P24610 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pax3P24610 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms