Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd12P23812 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hoxd12P23812 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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