Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfyaP23708 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NfyaP23708 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfyaP23708 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfyaP23708 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NfyaP23708 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfyaP23708 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NfyaP23708 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NfyaP23708 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NfyaP23708 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NfyaP23708 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NfyaP23708 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NfyaP23708 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfyaP23708 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms