Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZfaP23607 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZfaP23607 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZfaP23607 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZfaP23607 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZfaP23607 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZfaP23607 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZfaP23607 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZfaP23607 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZfaP23607 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZfaP23607 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZfaP23607 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZfaP23607 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZfaP23607 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZfaP23607 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZfaP23607 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZfaP23607 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZfaP23607 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZfaP23607 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZfaP23607 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZfaP23607 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZfaP23607 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZfaP23607 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.2 ms