Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tap1P21958 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tap1P21958 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tap1P21958 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tap1P21958 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tap1P21958 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tap1P21958 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tap1P21958 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tap1P21958 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tap1P21958 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tap1P21958 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tap1P21958 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tap1P21958 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms