Protein–RNA interactions for Protein: P21440

Abcb4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb4P21440 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcb4P21440 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcb4P21440 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcb4P21440 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcb4P21440 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcb4P21440 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcb4P21440 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcb4P21440 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcb4P21440 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcb4P21440 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcb4P21440 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcb4P21440 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcb4P21440 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcb4P21440 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcb4P21440 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcb4P21440 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcb4P21440 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcb4P21440 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcb4P21440 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcb4P21440 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abcb4P21440 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcb4P21440 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms