Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ms4a2P20490 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ms4a2P20490 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ms4a2P20490 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ms4a2P20490 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ms4a2P20490 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ms4a2P20490 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ms4a2P20490 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ms4a2P20490 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ms4a2P20490 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ms4a2P20490 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ms4a2P20490 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ms4a2P20490 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ms4a2P20490 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms