Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka3P18654 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms