Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
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Hoxb1P17919 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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Hoxb1P17919 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Hoxb1P17919 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxb1P17919 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms