Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata1P17679 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata1P17679 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata1P17679 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata1P17679 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata1P17679 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata1P17679 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata1P17679 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata1P17679 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata1P17679 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.1 ms