Protein–RNA interactions for Protein: P17439

Gba, Glucosylceramidase, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GbaP17439 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GbaP17439 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GbaP17439 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GbaP17439 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GbaP17439 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GbaP17439 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GbaP17439 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GbaP17439 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GbaP17439 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GbaP17439 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GbaP17439 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GbaP17439 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GbaP17439 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GbaP17439 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GbaP17439 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GbaP17439 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GbaP17439 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GbaP17439 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GbaP17439 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GbaP17439 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GbaP17439 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GbaP17439 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GbaP17439 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GbaP17439 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GbaP17439 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GbaP17439 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GbaP17439 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GbaP17439 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GbaP17439 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GbaP17439 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GbaP17439 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GbaP17439 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GbaP17439 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GbaP17439 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GbaP17439 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GbaP17439 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GbaP17439 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GbaP17439 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GbaP17439 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GbaP17439 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GbaP17439 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GbaP17439 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GbaP17439 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GbaP17439 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GbaP17439 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GbaP17439 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GbaP17439 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GbaP17439 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GbaP17439 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GbaP17439 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GbaP17439 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GbaP17439 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GbaP17439 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GbaP17439 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GbaP17439 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GbaP17439 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GbaP17439 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GbaP17439 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GbaP17439 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GbaP17439 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GbaP17439 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GbaP17439 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GbaP17439 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GbaP17439 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GbaP17439 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GbaP17439 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GbaP17439 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GbaP17439 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GbaP17439 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GbaP17439 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GbaP17439 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GbaP17439 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GbaP17439 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GbaP17439 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GbaP17439 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GbaP17439 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GbaP17439 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GbaP17439 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GbaP17439 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GbaP17439 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GbaP17439 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GbaP17439 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GbaP17439 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GbaP17439 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GbaP17439 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GbaP17439 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GbaP17439 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GbaP17439 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GbaP17439 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GbaP17439 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GbaP17439 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GbaP17439 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GbaP17439 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GbaP17439 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GbaP17439 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GbaP17439 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GbaP17439 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GbaP17439 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GbaP17439 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GbaP17439 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms