Protein–RNA interactions for Protein: P16951

Atf2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf2P16951 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf2P16951 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf2P16951 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf2P16951 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf2P16951 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf2P16951 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf2P16951 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf2P16951 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf2P16951 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atf2P16951 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf2P16951 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf2P16951 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf2P16951 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf2P16951 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf2P16951 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf2P16951 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf2P16951 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf2P16951 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf2P16951 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf2P16951 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf2P16951 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf2P16951 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf2P16951 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms