Protein–RNA interactions for Protein: P16330

Cnp, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnpP16330 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CnpP16330 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CnpP16330 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CnpP16330 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CnpP16330 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CnpP16330 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CnpP16330 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CnpP16330 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CnpP16330 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CnpP16330 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CnpP16330 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CnpP16330 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CnpP16330 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CnpP16330 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CnpP16330 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CnpP16330 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CnpP16330 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CnpP16330 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CnpP16330 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CnpP16330 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CnpP16330 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CnpP16330 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CnpP16330 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CnpP16330 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CnpP16330 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CnpP16330 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CnpP16330 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CnpP16330 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CnpP16330 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CnpP16330 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CnpP16330 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CnpP16330 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CnpP16330 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CnpP16330 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CnpP16330 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CnpP16330 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CnpP16330 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CnpP16330 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CnpP16330 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CnpP16330 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CnpP16330 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CnpP16330 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CnpP16330 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CnpP16330 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CnpP16330 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CnpP16330 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CnpP16330 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CnpP16330 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CnpP16330 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CnpP16330 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CnpP16330 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CnpP16330 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CnpP16330 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CnpP16330 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CnpP16330 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CnpP16330 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CnpP16330 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CnpP16330 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CnpP16330 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CnpP16330 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CnpP16330 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CnpP16330 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CnpP16330 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CnpP16330 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CnpP16330 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CnpP16330 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CnpP16330 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CnpP16330 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CnpP16330 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CnpP16330 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CnpP16330 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CnpP16330 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CnpP16330 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CnpP16330 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CnpP16330 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CnpP16330 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CnpP16330 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CnpP16330 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CnpP16330 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CnpP16330 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CnpP16330 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CnpP16330 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CnpP16330 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CnpP16330 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CnpP16330 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CnpP16330 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CnpP16330 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CnpP16330 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CnpP16330 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CnpP16330 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CnpP16330 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CnpP16330 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CnpP16330 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CnpP16330 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CnpP16330 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CnpP16330 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CnpP16330 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CnpP16330 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CnpP16330 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CnpP16330 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.9 ms