Protein–RNA interactions for Protein: P13412

Tnni2, Troponin I, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni2P13412 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnni2P13412 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnni2P13412 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnni2P13412 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnni2P13412 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnni2P13412 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnni2P13412 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tnni2P13412 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tnni2P13412 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tnni2P13412 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnni2P13412 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnni2P13412 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnni2P13412 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnni2P13412 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnni2P13412 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnni2P13412 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnni2P13412 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnni2P13412 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnni2P13412 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnni2P13412 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnni2P13412 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnni2P13412 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnni2P13412 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnni2P13412 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnni2P13412 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnni2P13412 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnni2P13412 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnni2P13412 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnni2P13412 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnni2P13412 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnni2P13412 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnni2P13412 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnni2P13412 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnni2P13412 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnni2P13412 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms