Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms