Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd1d1P11609 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd1d1P11609 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd1d1P11609 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd1d1P11609 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd1d1P11609 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd1d1P11609 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd1d1P11609 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd1d1P11609 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd1d1P11609 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd1d1P11609 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd1d1P11609 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd1d1P11609 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd1d1P11609 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd1d1P11609 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd1d1P11609 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd1d1P11609 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd1d1P11609 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd1d1P11609 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd1d1P11609 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd1d1P11609 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd1d1P11609 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd1d1P11609 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd1d1P11609 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd1d1P11609 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms