Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fv4P11370 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fv4P11370 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fv4P11370 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fv4P11370 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fv4P11370 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fv4P11370 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fv4P11370 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fv4P11370 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fv4P11370 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fv4P11370 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Fv4P11370 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fv4P11370 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fv4P11370 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fv4P11370 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fv4P11370 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fv4P11370 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fv4P11370 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fv4P11370 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fv4P11370 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fv4P11370 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fv4P11370 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fv4P11370 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fv4P11370 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fv4P11370 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fv4P11370 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fv4P11370 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fv4P11370 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fv4P11370 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 282.5 ms