Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd8bP10300 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms