Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ly6c1P0CW02 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms