Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Igsf6P0C6B7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igsf6P0C6B7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms