Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Surf1P09925 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Surf1P09925 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Surf1P09925 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Surf1P09925 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Surf1P09925 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Surf1P09925 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Surf1P09925 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Surf1P09925 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Surf1P09925 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Surf1P09925 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Surf1P09925 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Surf1P09925 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Surf1P09925 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Surf1P09925 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Surf1P09925 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Surf1P09925 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Surf1P09925 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Surf1P09925 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Surf1P09925 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Surf1P09925 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Surf1P09925 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Surf1P09925 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Surf1P09925 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Surf1P09925 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Surf1P09925 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Surf1P09925 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Surf1P09925 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Surf1P09925 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Surf1P09925 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Surf1P09925 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Surf1P09925 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 691.1 ms