Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc8P09025 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc8P09025 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc8P09025 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc8P09025 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc8P09025 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc8P09025 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc8P09025 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc8P09025 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc8P09025 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc8P09025 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc8P09025 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc8P09025 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc8P09025 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc8P09025 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc8P09025 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc8P09025 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc8P09025 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc8P09025 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms