Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa1P09022 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa1P09022 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms