Protein–RNA interactions for Protein: P06795

Abcb1b, Multidrug resistance protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1bP06795 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb1bP06795 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb1bP06795 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb1bP06795 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb1bP06795 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb1bP06795 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb1bP06795 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb1bP06795 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb1bP06795 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb1bP06795 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Abcb1bP06795 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 230.5 ms