Protein–RNA interactions for Protein: P04235

Cd3d, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3dP04235 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cd3dP04235 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cd3dP04235 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms