Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt1P04104 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt1P04104 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt1P04104 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt1P04104 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt1P04104 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt1P04104 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt1P04104 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms