Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxa7P02830 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxa7P02830 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxa7P02830 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms