Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms