Protein–RNA interactions for Protein: P01804

Ig heavy chain V-III region HPC76 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01804 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01804 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01804 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01804 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01804 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01804 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01804 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01804 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01804 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01804 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01804 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01804 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01804 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01804 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01804 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01804 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01804 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01804 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01804 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01804 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01804 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01804 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01804 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01804 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01804 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01804 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01804 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01804 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01804 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01804 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01804 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01804 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01804 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01804 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01804 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P01804 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01804 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01804 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01804 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01804 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01804 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01804 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01804 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01804 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01804 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01804 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01804 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01804 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01804 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P01804 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01804 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01804 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01804 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01804 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01804 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01804 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01804 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01804 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01804 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01804 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01804 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01804 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01804 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01804 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01804 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01804 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01804 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01804 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01804 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01804 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01804 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01804 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01804 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01804 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01804 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01804 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01804 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01804 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01804 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01804 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01804 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01804 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01804 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01804 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01804 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01804 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
P01804 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01804 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
P01804 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01804 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01804 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01804 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01804 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01804 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
P01804 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01804 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01804 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01804 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01804 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01804 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms