Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01747 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01747 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01747 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01747 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01747 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01747 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01747 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01747 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01747 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01747 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01747 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01747 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01747 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01747 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01747 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01747 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01747 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01747 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01747 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01747 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01747 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01747 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01747 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01747 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01747 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01747 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01747 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
P01747 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
P01747 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01747 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01747 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01747 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01747 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01747 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01747 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01747 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01747 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01747 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01747 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01747 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01747 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01747 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01747 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01747 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01747 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01747 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01747 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
P01747 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01747 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01747 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01747 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01747 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01747 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01747 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01747 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01747 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01747 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01747 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P01747 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01747 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01747 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01747 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01747 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01747 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01747 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01747 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01747 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01747 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01747 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01747 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01747 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01747 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01747 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01747 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01747 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01747 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01747 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01747 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01747 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01747 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01747 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01747 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01747 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01747 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01747 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01747 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01747 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01747 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01747 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01747 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01747 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01747 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01747 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01747 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01747 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01747 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01747 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01747 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01747 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms