Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01660 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01660 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01660 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01660 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01660 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01660 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01660 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01660 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01660 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01660 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01660 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01660 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01660 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01660 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01660 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01660 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01660 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01660 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01660 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01660 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
P01660 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01660 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01660 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01660 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01660 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01660 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01660 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01660 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01660 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01660 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01660 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01660 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01660 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01660 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01660 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01660 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01660 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01660 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01660 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01660 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01660 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01660 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01660 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01660 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01660 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01660 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01660 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01660 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01660 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01660 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P01660 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01660 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01660 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01660 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01660 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01660 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01660 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01660 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01660 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01660 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
P01660 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01660 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01660 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01660 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01660 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01660 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01660 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01660 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01660 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01660 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01660 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01660 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P01660 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01660 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01660 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01660 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01660 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01660 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01660 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01660 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01660 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01660 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01660 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01660 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01660 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01660 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01660 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01660 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
P01660 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01660 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01660 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01660 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
P01660 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
P01660 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
P01660 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01660 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01660 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01660 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01660 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms