Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01641 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
P01641 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01641 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01641 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01641 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01641 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01641 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01641 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01641 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01641 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01641 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01641 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01641 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01641 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01641 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01641 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01641 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01641 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01641 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
P01641 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01641 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01641 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01641 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01641 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01641 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01641 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01641 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01641 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01641 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01641 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01641 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01641 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01641 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01641 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01641 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01641 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01641 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01641 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01641 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01641 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01641 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01641 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01641 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01641 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01641 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01641 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
P01641 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01641 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01641 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01641 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01641 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01641 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01641 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01641 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01641 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01641 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01641 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01641 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01641 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01641 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01641 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01641 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01641 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01641 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01641 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01641 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01641 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01641 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01641 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01641 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01641 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01641 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01641 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01641 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01641 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01641 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01641 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01641 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01641 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
P01641 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01641 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01641 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01641 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01641 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01641 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01641 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01641 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01641 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01641 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01641 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01641 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
P01641 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
P01641 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01641 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
P01641 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
P01641 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
P01641 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01641 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01641 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms